Search Result
Gene id | 676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Summary SNPs Protein Summary Gene ontology Diseases PubMed | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Summary |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BRDT Gene UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aliases | BRD6, CT9, SPGF21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene name | bromodomain testis associated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternate names | bromodomain testis-specific protein, RING3-like protein, bromodomain, testis-specific, cancer/testis antigen 9, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene location |
1p22.1 (91949370: 92014427) Exons: 21 NC_000001.11 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene summary(Entrez) |
BRDT is similar to the RING3 protein family. It possesses 2 bromodomain motifs and a PEST sequence (a cluster of proline, glutamic acid, serine, and threonine residues), characteristic of proteins that undergo rapid intracellular degradation. The bromodom |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs |
rs10783071 Strand: Allele origin: Allele change: Mutation type: snv NC_000001.11 g.91962938C>A NC_000001.10 g.92428495C>A XM_006710853.4 c.184C>A XM_006710855.4 c.184C>A XM_006710854.4 c.184C>A XM_006710856.4 c.184C>A XM_006710857.4 c.184C>A NM_001726.4 c.184C>A NM_001726.3 c.184C>A NM_207189.3 c.184C>A NM_207189.2 c rs10747493 Strand: Allele origin: Allele change: Mutation type: snv NC_000001.11 g.91992286C>A NC_000001.11 g.91992286C>G NC_000001.11 g.91992286C>T NC_000001.10 g.92457843C>A NC_000001.10 g.92457843C>G NC_000001.10 g.92457843C>T XM_006710853.4 c.2087C>A XM_006710853.4 c.2087C>G XM_006710853.4 c.2087C>T XM_006710855. rs6563386 Strand: Allele origin: Allele change: Mutation type: snv NC_000013.11 g.36202894C>A NC_000013.11 g.36202894C>G NC_000013.11 g.36202894C>T NC_000013.10 g.36777031C>A NC_000013.10 g.36777031C>G NC_000013.10 g.36777031C>T NG_033786.1 g.16722G>T NG_033786.1 g.16722G>C NG_033786.1 g.16722G>A|SEQ=[C/A/G/T]|GENE= rs1328626 Strand: Allele origin: Allele change: Mutation type: snv NC_000013.11 g.36204635C>A NC_000013.10 g.36778772C>A NG_033786.1 g.14981G>T|SEQ=[C/A]|GENE=SOHLH2 CCDC169-SOHLH2 100526761 rs3088232 Strand: Allele origin: Allele change: Mutation type: snv NC_000001.11 g.91979700C>G NC_000001.11 g.91979700C>T NC_000001.10 g.92445257C>G NC_000001.10 g.92445257C>T XM_006710853.4 c.1230C>G XM_006710853.4 c.1230C>T XM_006710855.4 c.1230C>G XM_006710855.4 c.1230C>T XM_006710854.4 c.1230C>G XM_006710854.4 c. |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Summary |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein general information | Q58F21 Name: Bromodomain testis specific protein (Cancer/testis antigen 9) (CT9) (RING3 like protein) Length: 947 Mass: 107,954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVKLQLPDYYTIIKNPMD LNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGT QQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAV KASSEFSPTFTEKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSK IPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNK KKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKL PGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTE VKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTV KNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDEL FNQFRKAAIEKEVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural information |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Databases | GeneCards: BRDT  Malacards: BRDT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene ontology
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Diseases
Expand All | Collapse All |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubMed references
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|